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こんばんは。猫山と申します。神経内科医です。
肺炎の予防接種では、肺炎球菌以外の病原体による肺炎は防ぐことが出来ません。
http://www.haien-yobou.jp/inoculation.xhtmlインフルエンザも、感染した場合に重症化を防ぐワクチンですので、感染を予防できるわけではありません。
脳梗塞そのものの症状として熱が出ることはあります。
時期的に感染症による発熱ももちろん否定はできません。
「現状を予想されること」はそれくらいだと思います。
入院されているわけですからご家族に「出来ること」は限られているでしょう。
発熱の原因を探るべき診察と検査を求められるべきだと考えます。
以上、ご参考になれば幸いです。