初めまして、ジャストアンサーの法律専門家Loweです。こちらのサイトは一問一答制になっておりまして、今回のご質問の担当をさせていただきます。よろしくお願いいたします。
尚、回答については順に対応していますので、少々お時間がかかることがありますが、ご了承ください。
従業員が業務中（通勤中も含む）に起こした事故は基本的に会社に管理責任があり、会社が事故を起こした従業員に代わって損害等の責任を持ちます。ですから、仮に転職までに決着がつかなかった場合、会社の車で会社の保険ということですから、会社対相手になり、貴方の転職には支障が出ません。事故当時に管理責任が会社に合ったということになり、その後事故を起こした従業員が退職をしてもそのまま引き続き会社が責任を持つということです。